一种在早期肝癌中免疫增强的分子亚型的研究方法

摘要

本发明涉及分子免疫技术领域，且公开了一种在早期肝癌中免疫增强的分子亚型的研究方法，包括以下步骤：S1、数据下载；S2、数据预处理：TCGA的转录组数据：将其转换为TPM表达谱；Metagene得分：选择样本在各个基因中的表达水平的中位数作为样本在免疫metagenes的得分；免疫相关细胞的MCP计数：使用R软件包MCPcounter‘对样本中免疫细胞的得分进行计算；样本免疫细胞得分。该种在早期肝癌中免疫增强的分子亚型的研究方法，收集来自TCGA的转录组的数据，并进行数据预处理和免疫基因筛选，最后利用R软件包对分子亚型与相关临床特征、免疫和突变等的关系进行软件分析，从而实现对免疫检查点分子在肝癌中的表达模式和潜在的临床相关性进行研究。