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细胞Hi-C测序文库的构建方法

摘要

本发明提供了一种细胞Hi‑C测序文库的构建方法。该构建方法包括采用体积≤800μL且甲醛终浓度为1.5~2.2%的交联体系对105数量级细胞进行甲醛交联固定,然后采用优化的裂解体系及温度对交联细胞进行处理,得到细胞核悬液;对细胞核进行Hi‑C文库构建得到Hi‑C测序文库;细胞膜裂解液包括终浓度分别如下的成分:pH 7.8~8.2,9~11mM的Tris‑HCl、9~11mM NaCl、0.1~0.3%的CA‑630、1×的蛋白酶抑制剂。小体积体系对低细胞起始量固定,并优化细胞膜裂解体系及反应条件,确保细胞核的完整性,提高了细胞核DNA的量及纯度,进而提高建库效率(提高有效数据的占比)。

著录项

  • 公开/公告号CN111778563A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-10-16

    原文格式PDF

  • 申请/专利号CN202010725027.2

  • 发明设计人 李新;刘贝贝;李瑞强;赵桂仿;

    申请日2020-07-24

  • 分类号C40B50/06(20060101);

  • 代理机构11240 北京康信知识产权代理有限责任公司;

  • 代理人路秀丽

  • 地址 301700 天津市武清区开发区创业总部基地B07

  • 入库时间 2023-06-19 08:34:56

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