一种基于计算生物学筛选提高沉香倍半萜合酶活性的关键氨基酸位点的方法

摘要

本发明公开了一种基于计算生物学筛选提高沉香倍半萜合酶活性的关键氨基酸位点的方法，包括如下步骤：1)获得沉香等68条倍半萜合酶相关序列；2)通过Modeltest、PAUP*和MrBayes等软件构建倍半萜合酶系统发育树；3)采用PAML软件的位点模型、枝模型和枝位点模型检测倍半萜合酶的正选择位点；4)对沉香倍半萜合酶进行同源建模，通过PyMOL软件显示正选择位点；5)运用Discovery Studio软件进行沉香倍半萜合酶突变体的计算分析。结果表明，247Q、403D、412P、426Y、470G和538S等6个正选择位点与沉香倍半萜合酶功能位点或功能保守区密切相关；D403R、G470Q和S538K突变后有利于提高沉香倍半萜合酶活性与稳定性。本发明方法基于计算生物学，操作简单，能够实现经济快捷筛选提高沉香倍半萜合酶活性的关键氨基酸位点。