GBS获取白菜类作物基因组SNP构建指纹图谱的方法

摘要

本发明提供一种基于GBS技术获取白菜类作物全基因组高密度SNP位点构建指纹图谱的方法，包括：(1)设计不同的酶切方案，预测单酶切或双酶切白菜类材料基因组所获得的酶切片段分布情况；(2)根据酶切片段分布特点设计条形码接头及PCR扩增引物；(3)构建简化基因组测序文库；(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点，用于构建指纹图谱。本发明为不同白菜类作物材料利用GBS构建全基因组高密度SNP图谱提供了一种通用策略，该方法降低了测序成本，酶切位点在基因组上分布均匀，利用本方法对100份白菜类材料进行了测序，费用可降低70％左右，获得的多态性位点足够用于性状分析。