一种基于距离谱知识的正态分布距离接收概率模型构建方法

摘要

一种基于距离谱知识的正态分布距离接收概率模型构建方法，首先，下载蛋白质数据库中结构已知的高分辨率蛋白质文件，通过比较序列相似度去除同源性大于预设阈值的序列构成非冗余模板库；其次，通过一个滑动窗口对模板库中的蛋白质结构与查询序列进行相似度比较，选出查询序列每个位置中得分最高的前M个片段构成片段库文件；然后选取查询序列两个位置上片段库中来自于同一模板片段结构的距离构成距离谱；最后根据残基间距离谱的距离分布，提取预测距离和方差对其构建正态分布的概率密度函数，比对诱导构象的结构相似性，并以正态分布的距离接收概率接受构象。本发明空间采样能力较强、更新精度较高。