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一种抗菌蛋白质或多肽活性关系表征的方法

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本发明公开了一种抗菌蛋白质或多肽活性关系表征的方法，从表征分子的85个结构参量和拓扑指数出发,经主成分分析(PCA)得到一种包含166个氨基酸体系的特征描述子:氨基酸拓扑结构信息矢量(VSTPV).将其应用于101个阳离子抗菌肽和28个牛乳铁蛋白水解肽(BPPs))的定量构效关系(QSAR)研究,均有较好的拟合和预测能力,交叉验证相关系数和相关系数都在0.70以上。研究表明氨基酸残基拓扑结构信息矢量VSTPV能很好的表征编码与非编码氨基酸并能建立预测能力较强的多肽及其衍生物QSAR模型。

著录项

公开/公告号CN102663271A

专利类型发明专利
公开/公告日2012-09-12

原文格式PDF
申请/专利权人重庆理工大学;
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申请/专利号CN201210139079.7
发明设计人舒茂;林治华;张云茹;路亚阔;
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申请日2012-05-08
分类号G06F19/24;
代理机构成都九鼎天元知识产权代理有限公司;
代理人徐宏
地址 400054 重庆市巴南区红光大道69号
入库时间 2023-12-18 06:28:50

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2015-09-02

发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):G06F19/24 申请公布日:20120912 申请日:20120508

发明专利申请公布后的视为撤回
2012-11-07

实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/24 申请日:20120508

实质审查的生效
2012-09-12

公开

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1. 一种抗菌蛋白质或多肽活性关系表征的方法 [P] . 中国专利： CN102663271A . 2012-09-12
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3. isolated polypetide, composition, recombinant host cell, methods for producing the polypetide, a polypetide having cellulolytic enhancer activity, a precursor cell mutant, a protein and a fermentation product, transgenic plant, plant part or plant cell, double stranded inhibitor (rsrna), and methods for inhibiting expression of a polypeptide having cellulolytic enhancer activity in a cell, degrading or converting an isolated polypeptide, composition, recombinant host cell, methods for producing the polypetide, a polypetide having activity cellulolytic enhancer, a precursor cell mutant, a protein and a fermentation product, a transgenic plant, a plant part or a plant cell, a double stranded inhibitor (dsrna) molecule, and methods for inhibiting expression of a polypeptide having cellulolytic enhancer activity in a cell, degrade or convert r a cellulosic material and ferment a cellulosic material. [P] . BR112012006032A2 . 2015-09-08

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