一种寻找调控一组相关基因的转录因子的计算方法

摘要

本发明属于计算生物学领域，具体涉及一种寻找调控一组相关基因的转录因子的计算方法。通过计算转录因子在一组相关基因中结合位点的实际个数与期望个数的比值，来判定转录因子与这组基因的关系。如果比值高于预先计算的共调控显著性阈值，则认为转录因子与这组基因有关。共调控显著性阈值则是位点权重矩阵算法的特异性、共调控比和总体调控率确定的。该方法大大提高了预测调控相关基因的转录因子的准确性，从生物学特征出发界定相关基因的关系和共调控的比例，涉及参数少且计算方法简单，便于生物学家应用。