基于序列比对核函数预测信号肽及其断裂点位置实现方法

摘要

一种基于序列比对核函数预测信号肽及其断裂点位置实现方法，属于生物工程技术领域。本发明采用全局序列比对以解决所研究的氨基酸序列长度不一致的难题，并计算两氨基酸序列之间的统计相关性以表征两者之间的相似度，通过将相似度矩阵转换为非负定矩阵后经过空间转换得到新坐标，从而解决不满足非负定性条件的矩阵如何生成核矩阵的问题。对于新测定的氨基酸序列在新特征空间可预测其是否信号肽并判定其断裂点位置。本发明提高了以往预测信号肽的正确率以及断裂点的预测率，从而对于理解某些疾病的致病过程有极大促进作用，进而有助于开发有效的治疗方案。