一种蛋白质结构势能函数的预测方法

摘要

本发明涉及一种蛋白质结构势能函数的预测方法，包括以下步骤：1)计算蛋白质结构中氨基酸的短程相互作用、长程相互作用以及肽键能量；2)根据肽键的长程相互作用、短程相互作用以及肽键能量初步生成蛋白质结构势能函数；3)准备蛋白质结构已知的蛋白质数据；4)通过蛋白质结构已知的蛋白质数据训练初步生成的蛋白质结构势能函数，直至获得最终蛋白质结构势能函数。本方法采用肽键作为函数的基本单位，更加贴合蛋白质的实际结构，更加全面的考量了蛋白质内部的相互作用，肽键是蛋白质组成的基本单元，具有40％双键的性质，限制了原子的旋转，使用肽键作为结构打分函数的基本作用单位，更加符合蛋白质中氨基酸的相互作用机制。