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使用K聚体在没有比对的情况下进行测序数据的快速质量控制

摘要

一种用于使用质量控制分析系统(300)来评价核酸测序数据的方法(200),包括:接收(210)核酸序列的多个读取;从多个读取中提取(220)多个k聚体;使用多个提取的k聚体来识别(230)在所述多个读取中发现的多个被注释的k聚体中的一个或多个,其中,多个提取的k聚体被存储在注释数据库中(350),并且此外,其中,被注释的k聚体利用关于从其生成被注释的k聚体的一个或多个核酸序列的注释信息来注释;基于在多个读取中发现的所识别的被注释的k聚体来收集(240)关于多个读取的注释信息;并且基于所收集的注释信息来确定(250)针对多个读取中的至少一些读取的质量控制度量。

著录项

  • 公开/公告号CN111492436A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-08-04

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 皇家飞利浦有限公司;

    申请/专利号CN201880079257.7

  • 发明设计人 吴捷;Y·H·张;

    申请日2018-11-07

  • 分类号G16B30/10(20060101);

  • 代理机构72002 永新专利商标代理有限公司;

  • 代理人孟杰雄

  • 地址 荷兰艾恩德霍芬

  • 入库时间 2023-12-17 11:32:46

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-08-04

    公开

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