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基于可变剪接差异的基因分析方法、系统、装置及介质

摘要

本发明公开了一种基于可变剪接差异的基因分析方法、系统、装置及介质。该方法通过从样本集中获取基因数据,基于所述基因数据,分别获取单个基因各个异构体在癌症和正常状态下的表达量,然后通过散度对基因每个异构体在癌症和正常状态下的表达差异进行分析,得到基因的散度值,最后对各个基因的散度值进行排序,并输出散度值大于预设散度阈值的基因数据。该系统包括获取模块、处理模块、分析模块和排序模块。通过使用本发明中的方法,能够方便高效地分析在可变剪接整体上发生显著变化的紊乱基因,更快速地定位出潜在的癌症相关基因,整个过程简单,计算复杂度低。本发明可广泛应用于生物基因技术领域内。

著录项

  • 公开/公告号CN111223521A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-06-02

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 广州大学;

    申请/专利号CN202010008463.8

  • 发明设计人 刘文斌;

    申请日2020-01-06

  • 分类号

  • 代理机构广州嘉权专利商标事务所有限公司;

  • 代理人黎扬鹏

  • 地址 510006 广东省广州市大学城外环西路230号

  • 入库时间 2023-12-17 09:21:04

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-06-26

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/00 申请日:20200106

    实质审查的生效

  • 2020-06-02

    公开

    公开

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