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以废水处理样品微生物元基因组序列拼接细菌基因组的方法

摘要

本发明公开了一种以废水处理样品微生物元基因组序列拼接细菌基因组的方法,所述方法包括如下步骤:步骤一,获得样品的元基因组序列;步骤二,根据群落结构信息确定优势细菌的分类地位;步骤三,依据优势细菌的相似菌的参考基因组序列,从元基因组序列中挑出相似序列;步骤四,对相似序列进行拼接,添加人工接头序列,获得细菌的基因组草图。本发明通过从反应器污泥微生物元基因组序列中拼接细菌基因组,能够不经过分离细菌获得培养物就可获得细菌的基因组,从而可以实现对难以分离培养的细菌的基因组进行研究,进而获得该细菌的代谢功能特性的方法。

著录项

  • 公开/公告号CN104278091A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2015-01-14

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海交通大学;

    申请/专利号CN201410503190.9

  • 申请日2014-09-26

  • 分类号C12Q1/68;C12R1/01;

  • 代理机构上海汉声知识产权代理有限公司;

  • 代理人郭国中

  • 地址 200240 上海市闵行区东川路800号

  • 入库时间 2023-12-17 02:29:08

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-03-20

    发明专利申请公布后的驳回 IPC(主分类):C12Q1/68 申请公布日:20150114 申请日:20140926

    发明专利申请公布后的驳回

  • 2015-02-11

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20140926

    实质审查的生效

  • 2015-01-14

    公开

    公开

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