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基于Sant-75结构的化合物

摘要

本发明涉及一种基于Sant-75结构的化合物,通过对Sant-75的结构进行修饰,提供至少一种具有更好生物学活性的基于Sant-75结构的化合物,其结构式可以为:其中,-R1为-H、-F或-Cl;-R2为-H、-F或-OH;-R3为-H、-F、-Cl、-OH、-NO2、-NH2、-Me、-SO2Me、-CO2Me、-CO2H、-NHAc或-NHSO2Me;-R4为-H、-F、-Cl或-SO2Me;并且-R1、-R2、-R3和-R4不同时为-H。上述基于Sant-75结构的化合物,通过对Sant-75进行系统的结构修饰,相对于Sant-75,其作为七次穿膜蛋白抑制剂的生物学活性较高。

著录项

  • 公开/公告号CN103319470A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2013-09-25

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京大学深圳研究生院;

    申请/专利号CN201210081946.6

  • 发明设计人 林硕;杨震;车超;李松;

    申请日2012-03-23

  • 分类号C07D409/12(20060101);C07D495/04(20060101);C07D409/14(20060101);C07D333/38(20060101);A61P35/00(20060101);

  • 代理机构44224 广州华进联合专利商标代理有限公司;

  • 代理人何平

  • 地址 518057 广东省深圳市南山区西丽大学城北京大学校区

  • 入库时间 2024-02-19 19:59:10

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-10-31

    授权

    授权

  • 2015-04-29

    实质审查的生效 IPC(主分类):C07D409/12 申请日:20120323

    实质审查的生效

  • 2013-09-25

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明涉及蛋白抑制剂,特别是涉及一种基于Sant-75结构的化合物。

背景技术

七次穿膜蛋白(Smoothened,Smo)是Hedgehog(Hh)信号通路中的一个重要 组分。Hh信号通路参与正常的动物发育以及恶性肿瘤的发生,对后生动物的胚 胎和成体组织的动态平衡也必不可少。Hh信号通路包括四个主要组分:Hh配 体,十二次穿膜蛋白受体Patched1(Ptch1),七次穿膜蛋白受体Smo和Gli家族 的转录因子。Hh配体通过结合Ptch1来激活Hh信号通路,在非结合的状态, Ptch1受体抑制了下游七次穿膜蛋白受体Smo的活性;而Hh配体和Ptch1受体 的结合减轻了这种抑制作用,最终激活了Gli家族转录因子并移位到细胞核内, 引起靶基因的表达从而导致细胞的增值和分化。

Hh信号通路在正常的胚胎发生中调节细胞增殖和分化,由于其在调节细胞 命运和增殖方面的关键作用,过度激活的Hh通路参与了一些恶性肿瘤和癌症的 发生。基底细胞癌(Basal cell carcinoma,BCC)是西方国家最为普遍的癌症之 一,Ptch1和Smo的突变参与了其发生。在脑的发育中,Hh是小脑颗粒神经元 祖细胞(cerebellar granule neuron progenitors)的有丝分裂原,并在出生后的发 育中被下调。相比之下,大于30%的人成神经管细胞瘤显现出Gli1的高表达。 在人成神经管细胞瘤中也发现Ptch1和Smo的突变。

除了在胚胎发生中的作用,Hh信号通路也参与诸如血管发生和胰腺的器官 发生。在斑马鱼和小鼠中的研究表明,Hh的缺陷会导致血管结构的丧失。而Shh 缺陷小鼠会出现肺部脉管系统形成异常和支气管减少的表型。缺少Hh信号的斑 马鱼胚胎表现出初级节间血管出芽缺陷。Shh似乎可以通过调节血管生成素1, -2和VEGF的mRNA的水平来促进血管成熟。Hh信号通路也在肿瘤相关血管 发生中起重要作用。

近年来的研究还表明,异常的Hh信号还和许多其它恶性肿瘤的发生相关, 比如:小细胞肺癌、胰腺癌、乳腺癌和骨髓瘤等。因此发展有效的Hh信号通路 的阻断剂是抗肿瘤药物研究的新策略和新思路。

由于异常活化的Hh信号与人类疾病相关,而突变的Ptch1和Smo蛋白几乎 都导致Hh信号的异常活化,所以人们已经花费了很多精力去寻找确定作用于 Smo或其下游的治疗型抑制剂。如图1所示,环巴胺(cyclopamine)就是这样 一个化合物,它通过与Smo直接相互作用从而特异性地阻断Hh信号通路。环 巴胺是一种从植物中提取的甾体类生物碱,对Hh信号通路有抑制作用,当用其 癌症治疗时,肿瘤发生中的血管结构会显著降低。Smo和Patched中的致癌突变 似乎可以被环巴胺逆转。小规模的临床研究发现,局部施用环巴胺可以有效减 小BCC病灶的大小。环巴胺在鼠类肿瘤的同种异体移植模型中也可以导致髓质 母细胞瘤的衰退和凋亡。然而,环巴胺较差的水溶性(ca.5μg/mL)和酸不稳定性 阻碍了其在临床上治疗肿瘤的应用。

结合图1,SAG是Hh通路的激活剂,它与Smo蛋白有亲和力,但是却以 一种与环巴胺作用相反的方式。由于SAG在更高浓度也抑制Hh通路,因此可 以通过修饰其结构,开发出靶向Smo的抑制剂Sant-75,详请参见专利 CN101597280A。但是,在对Sant-75的进一步研究中发现,Sant-75作为七次穿 膜蛋白抑制剂的生物学活性较低,Sant-75的生物活性有待于进一步提高。

发明内容

基于此,通过对Sant-75的结构进行修饰,提供一种作为七次穿膜蛋白抑制 剂的生物学活性较高的基于Sant-75结构的化合物。

一种基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,-R1为-H、-F或-Cl;

-R2为-H、-F或-OH;

-R3为-H、-F、-Cl、-OH、-NO2、-NH2、-Me、-SO2Me、-CO2Me、-CO2H、 -NHAc或-NHSO2Me;

-R4为-H、-F、-Cl或-SO2Me;

并且-R1、-R2、-R3和-R4不同时为-H。

在一个实施例中,上述基于Sant-75结构的化合物,具有如下化学式:

一种基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

一种基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,为

一种基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,为

一种基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,-R1为-H或-n-Pr;

-R2为-CH3、-C2H5、-CH(CH3)2、-(CH2)2CH3、-n-Bu、-(CH2)4CH3、-(CH2)3CH3

-R3为-H或-Cl;

-R4为-H或-Cl。

在一个实施例中,上述基于Sant-75结构的化合物中,-R1为-H。

在一个实施例中,上述基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

在一个实施例中,上述基于Sant-75结构的化合物中,-R1为-n-Pr。

在一个实施例中,上述基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

上述基于Sant-75结构的化合物,通过对Sant-75进行系统的结构修饰,相 对于Sant-75,其作为七次穿膜蛋白抑制剂的生物学活性较高。

附图说明

图1为现有的几种Smo抑制剂和激活剂的结构对比图;

图2为一实施例的具有结构式(I)的化合物的制备方法的示意图;

图3为一实施例的具有化合物Hh-001的制备方法的示意图;

图4为一实施例的具有结构式(II)的化合物的制备方法的示意图;

图5为一实施例的具有结构式(III)的化合物的制备方法的示意图;

图6为一实施例的具有结构式(IV)的化合物的制备方法的示意图。

具体实施方式

通过对Sant-75进行系统的结构修饰,并借助于斑马鱼胚胎筛选和细胞实 验,发现如下具有更佳水溶性和药代动力学特性的Smo抑制剂。

一实施方式的基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,-R1为-H、-F或-Cl;

-R2为-H、-F或-OH;

-R3为-H、-F、-Cl、-OH、-NO2、-NH2、-Me、-SO2Me、-CO2Me、-CO2H、 -NHAc或-NHSO2Me;

-R4为-H、-F、-Cl或-SO2Me;

并且-R1、-R2、-R3和-R4不能同时为-H。

结合图2,具有结构式(I)的化合物的制备方法如下:

第一步骤——还原胺化(化合物2到化合物3):

将单Boc保护的反式环己二胺加入到化合物2的四氢呋喃溶液,室温搅拌 30分钟;然后在0℃加入三乙酰氧基硼氢化钠,并在室温中搅拌过夜;反应用 饱和碳酸钠淬灭后,用二氯甲烷提取三次,有机层合并之后用无水硫酸镁干燥, 真空浓缩后残渣由硅胶柱纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物3。

第二步骤——烷基化反应(化合物3到化合物4):

向化合物3的DMF溶液中加入氢化钠,反应在0℃搅拌1小时;然后滴加 碘丙烷,再升至室温搅拌3小时,反应用饱和碳酸氢钠淬灭后,用二氯甲烷萃 取三次;合并有机相,用无水硫酸钠干燥,有机相浓缩之后残渣用硅胶柱层析 纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物4。

第三步骤——酰基化反应(化合物4到化合物6):

化合物4和三乙胺溶于的二氯甲烷溶液,加入化合物5,室温搅拌2小时后, 移除溶剂,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:正己烷/乙酸乙酯=2/1)得到化合 物6。

第四步骤——脱Boc保护基(化合物6到具有结构式(I)的化合物):

化合物6溶于的二氯甲烷溶液,在0℃下加入三氟乙酸,室温搅拌1小时, 然后以饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷萃取三次,合并有机相并用无水硫酸 钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/丙酮/三乙胺 =40/10/1),得到具有结构式(I)的化合物。

在一个实施例中,上述具有结构式(I)的化合物为:

一实施方式的基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

结合图3,化合物Hh-001的制备方法如下:

第一步骤——还原胺化(化合物2到化合物3):

将单Boc保护的反式环己二胺加入到化合物2的四氢呋喃溶液,室温搅拌 30分钟;然后在0℃加入三乙酰氧基硼氢化钠,并在室温中搅拌过夜;反应用 饱和碳酸钠淬灭后,用二氯甲烷提取三次,有机层合并之后用无水硫酸镁干燥, 真空浓缩后残渣由硅胶柱纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物3。

第二步骤——烷基化反应(化合物3到化合物4):

向化合物3的DMF溶液中加入氢化钠,反应在0℃搅拌1小时;然后滴加 碘丙烷,再升至室温搅拌3小时,反应用饱和碳酸氢钠淬灭后,用二氯甲烷萃 取三次;合并有机相,用无水硫酸钠干燥,有机相浓缩之后残渣用硅胶柱层析 纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物4。

第三步骤——酰基化反应(化合物4到化合物6’):

化合物4和三乙胺溶于的二氯甲烷溶液,加入化合物5’,室温搅拌2小时 后,移除溶剂,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:正己烷/乙酸乙酯=2/1)得到 化合物6’。

第四步骤——脱Boc保护基(化合物6’到化合物Hh-001):

化合物6’溶于二氯甲烷溶液,在0℃下加入三氟乙酸,室温搅拌1小时, 然后以饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷萃取三次,合并有机相并用无水硫酸 钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/丙酮/三乙胺 =40/10/1),得到化合物Hh-001。

一实施方式的基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,为

上述具有结构式(II)的化合物,具体为:

结合图4,具有结构式(II)的化合物的制备方法如下:

第一步骤——还原胺化(化合物2a到化合物3a):

将单Boc保护的反式环己二胺加入到化合物2a的四氢呋喃溶液,室温搅拌 30分钟;然后在0℃加入三乙酰氧基硼氢化钠,并在室温中搅拌过夜;反应用 饱和碳酸钠淬灭后,用二氯甲烷提取三次,有机层合并之后用无水硫酸镁干燥, 真空浓缩后残渣由硅胶柱纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物3a。

第二步骤——烷基化反应(化合物3a到化合物4a):

向化合物3a的DMF溶液中加入氢化钠,反应在0℃搅拌1小时;然后滴 加碘丙烷,再升至室温搅拌3小时,反应用饱和碳酸氢钠淬灭后,用二氯甲烷 萃取三次;合并有机相,用无水硫酸钠干燥,有机相浓缩之后残渣用硅胶柱层 析纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物4a。

第三步骤——酰基化反应(化合物4a到化合物6a):

化合物4a和三乙胺溶于的二氯甲烷溶液,加入化合物5a,室温搅拌2小时 后,移除溶剂,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:正己烷/乙酸乙酯=2/1)得到 化合物6a。

第四步骤——脱Boc保护基(化合物6a到具有结构式(II)的化合物):

化合物6a溶于的二氯甲烷溶液,在0℃下加入三氟乙酸,室温搅拌1小时, 然后以饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷萃取三次,合并有机相并用无水硫酸 钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/丙酮/三乙胺 =40/10/1),得到具有结构式(II)的化合物。

一种基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,为

上述具有结构式(III)的化合物,具体为:

结合图5,具有结构式(III)的化合物的制备方法如下:

第一步骤——还原胺化(化合物2b到化合物3b):

将单Boc保护的反式环己二胺加入到化合物2b的四氢呋喃溶液,室温搅拌 30分钟;然后在0℃加入三乙酰氧基硼氢化钠,并在室温中搅拌过夜;反应用 饱和碳酸钠淬灭后,用二氯甲烷提取三次,有机层合并之后用无水硫酸镁干燥, 真空浓缩后残渣由硅胶柱纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物3b。

第二步骤——烷基化反应(化合物3b到化合物4b):

向化合物3b的DMF溶液中加入氢化钠,反应在0℃搅拌1小时;然后滴 加碘丙烷,再升至室温搅拌3小时,反应用饱和碳酸氢钠淬灭后,用二氯甲烷 萃取三次;合并有机相,用无水硫酸钠干燥,有机相浓缩之后残渣用硅胶柱层 析纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物4b。

第三步骤——酰基化反应(化合物4b到化合物6b):

化合物4b和三乙胺溶于的二氯甲烷溶液,加入化合物5b,室温搅拌2小时 后,移除溶剂,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:正己烷/乙酸乙酯=2/1)得到 化合物6b。

第四步骤——脱Boc保护基(化合物6b到具有结构式(II)的化合物):

化合物6b溶于的二氯甲烷溶液,在0℃下加入三氟乙酸,室温搅拌1小时, 然后以饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷萃取三次,合并有机相并用无水硫酸 钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/丙酮/三乙胺 =40/10/1),得到具有结构式(III)的化合物。

一种基于Sant-75结构的化合物,具有如下结构式:

其中,-R1为-H或-n-Pr;

-R2为-CH3、-C2H5、-CH(CH3)2、-(CH2)2CH3、-n-Bu、-(CH2)4CH3、-(CH2)3CH3

-R3为-H或-Cl;

-R4为-H或-Cl。

-n-Pr代表正丙基,-t-Bu代表叔丁基。

在一个实施例中,上述的具有结构式(IV)的化合物中,-R1为-H,结构式 为:

在一个实施例中,上述的具有结构式(IV)的化合物中,-R1为-n-Pr,结构 式为:

结合图6,具有结构式(IV)的化合物的制备方法如下:

第一步骤——还原胺化(化合物2c到化合物3c):

将单Boc保护的反式环己二胺加入到化合物2c的四氢呋喃溶液,室温搅拌 30分钟;然后在0℃加入三乙酰氧基硼氢化钠,并在室温中搅拌过夜;反应用 饱和碳酸钠淬灭后,用二氯甲烷提取三次,有机层合并之后用无水硫酸镁干燥, 真空浓缩后残渣由硅胶柱纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物3c。

第二步骤——烷基化反应(化合物3c到化合物4c):

向化合物3c的DMF溶液中加入氢化钠,反应在0℃搅拌1小时;然后滴 加碘丙烷,再升至室温搅拌3小时,反应用饱和碳酸氢钠淬灭后,用二氯甲烷 萃取三次;合并有机相,用无水硫酸钠干燥,有机相浓缩之后残渣用硅胶柱层 析纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=10/1)得到化合物4c。

第三步骤——酰基化反应/脱Boc保护基(化合物4c到化合物6c或化合物 3c到化合物6c’):

化合物4c或化合物3c和三乙胺溶于的二氯甲烷溶液,加入化合物5c,室 温搅拌2小时后,移除溶剂,残渣溶于的二氯甲烷溶液,在0℃下加入三氟乙 酸,室温搅拌1小时,然后以饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷萃取三次,合 并有机相并用无水硫酸钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液: 二氯甲烷/丙酮/三乙胺=40/10/1),得到化合物6c或6c’。

第四步骤——酰基化反应(化合物6c到具有结构式(IV)的化合物或6c’到 具有结构式(V)的化合物)

化合物6c或6c’和三乙胺溶于的二氯甲烷溶液,加入化合物酰氯R2COCl, 室温搅拌2小时后,移除溶剂,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲 醇=20/1)得到具有结构式(IV)或(V)的化合物。

在一个实施例中,上述的具有结构式(V)的化合物为:

在一个实施例中,上述的具有结构式(VI)的化合物为:

上述基于Sant-75结构的化合物,通过对Sant-75进行系统的结构修饰,相 对于Sant-75,其作为七次穿膜蛋白抑制剂的生物学活性较高。

以下为具体实施例部分。

实施例1

3-氯-6-硝基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并[b]噻吩 -2-甲酰胺(3-chloro-6-nitro-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl) -N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

结合图2,化合物4(84mg,0.2mmol)和三乙胺(42μL,0.30mmol)溶于4ml 的二氯甲烷溶液,加入6-硝基-3-氯代苯并噻吩酰氯(66mg,0.24mmol),室温 搅拌2小时后,移除溶剂,得到带有Boc保护基的Hh-0224粗产物。将该粗产 物溶于4ml的二氯甲烷溶液,在0℃下加入1ml三氟乙酸,室温搅拌1小时, 然后以4ml饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷(3×20mL)萃取,合并有机相 并用无水硫酸钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲 烷/丙酮/三乙胺=40/10/1)得到85mg目标产物Hh-0224,两步总收率为75%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.68(d,J=5.4Hz,2H), 8.28-8.42(br,1H),7.90-8.11(br,1H),7.26-7.67(m,7H),4.63-4.82(br,2H), 3.78-4.18(br,1H),2.68-2.90(br,m,3H),1.25-2.21(m,10H),0.89(t,J=7.2Hz, 3H);HRMS(ESI)理论值C30H32ClN4O3S[M+]:563.1884,实测值:563.1898。

实施例2

3-氯-6-甲氧羰基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并[b] 噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-6-methoxylcarbonyl-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl) -N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

结合图2,化合物4(84mg,0.2mmol)和三乙胺(42μL,0.30mmol)溶于4ml 的二氯甲烷溶液,加入6-甲氧羰基-3-氯代苯并噻吩酰氯(69mg,0.24mmol), 室温搅拌2小时后,移除溶剂,得到带有Boc保护基的Hh-006的粗产物。将该 粗产物溶于4ml的二氯甲烷溶液,在0℃下加入1ml三氟乙酸,室温搅拌1 小时,然后以4ml饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷(3×20mL)萃取,合并 有机相并用无水硫酸钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱液用: 二氯甲烷/丙酮/三乙胺=40/10/1)得到64mg目标产物Hh-006,两步总收率为 56%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.57-8.66(m,3H),7.26-8.19(m, 8H),4.84(s,2H),3.99(s,3H),3.76(m,1H),2.35-2.60(m,3H),1.28-2.04(m,10H), 0.83(t,J=6.7Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C32H35ClN3O3S[M+]:576.2088,实测 值:576.2079。

实施例3

3-氯-5,6-亚甲二氧基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基 苯并[b]噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-5,6-methylenedioxy-N-((trans)-4-(propylamino) cyclohexyl)-N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

结合图3,化合物4(84mg,0.2mmol)和三乙胺(42μL,0.30mmol)溶于4ml 的二氯甲烷溶液,加入5,6-亚甲二氧基-3-氯代苯并噻吩酰氯(66mg,0.24 mmol),室温搅拌2小时后,移除溶剂,得到带有Boc保护基的Hh-001的粗产 物。将该粗产物溶于4ml的二氯甲烷溶液,在0℃下加入1ml三氟乙酸,室 温搅拌1小时,然后以4ml饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷(3×20mL)萃 取,合并有机相并用无水硫酸钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗 脱液用:二氯甲烷/丙酮/三乙胺=40/10/1)得到81mg目标产物Hh-001,两步总 收率为72%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.65(d,J=4.5Hz,2H),7.30-7.68 (m,6H),7.15-7.20(m,2H),6.07(s,2H),4.77(s,2H),3.85(m,1H),2.33-2.55(m, 3H),1.83-1.97(m,5H),1.26(m,5H),0.87(t,J=6.7Hz,3H);HRMS(ESI)理论值 C31H33ClN3O3S[M+]:562.1931,实测值:562.1979。

实施例4

3,6,7-三氯-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并[b]噻吩 -2-甲酰胺(3,6,7-trichloro-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl)N-(3-(pyridin-4-yl) benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

结合图2,化合物4(84mg,0.2mmol)和三乙胺(42μL,0.30mmol)溶于4ml 的二氯甲烷溶液,加入5,6-亚甲二氧基-3-氯代苯并噻吩酰氯(71mg,0.24 mmol),室温搅拌2小时后,移除溶剂,得到带有Boc保护基的Hh-019的粗产 物。将该粗产物溶于4ml的二氯甲烷溶液,在0℃下加入1ml三氟乙酸,室 温搅拌1小时,然后以4ml饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷(3×20mL)萃 取,合并有机相并用无水硫酸钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗 脱液用:二氯甲烷/丙酮/三乙胺=40/10/1)得到92mg目标产物Hh-019,两步总 收率为78%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.66(d,J=4.2Hz,2H),7.46-7.68 (m,8H),4.69-4.85(br,2H),3.79(m,1H),2.42-2.72(m,3H),1.80-2.08(m,4H), 1.24-1.68(m,6H),0.87(t,J=6.7Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C30H31Cl3N3OS [M+]:586.1253,实测值:586.1232。

实施例5

3-氯-6-氨基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并[b]噻吩 -2-甲酰胺(3-chloro-6-amino-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl)-N-(3-(pyridin-4 -yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

实施例1制得的带有Boc保护基的Hh-0224(331mg,0.5mmol)溶于5ml 的DMF和水(1∶1)的混合溶剂中,加入FeCl3(225mg,1.5mmol),锌粉(325mg, 5mmol)。混合物在100℃反应1小时。当反应转化完全后,过滤混合物,滤液 用10ml水稀释,接着加入饱和的Na2CO3溶液中和反应体系,并用二氯甲烷(3x 10ml)萃取,无水硫酸钠干燥。浓缩后得到带有Boc保护基的Hh-0227的粗产物。 将该粗产物溶于10ml的二氯甲烷溶液,在0℃下加入2ml三氟乙酸,室温搅 拌1小时,然后以4ml饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷(3×30mL)萃取, 合并有机相并用无水硫酸钠干燥;真空浓缩后,残渣由硅胶柱层析纯化(洗脱 液:二氯甲烷/甲醇=30/1)得到191mg目标产物Hh-0227,两步总收率为72%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,DMSO)δ8.63(s,2H),7.47-7.64(m,7H), 6.83-7.02(m,2H),5.71(s,2H),4.75(s,2H),3.72(m,1H),2.7-2.89(m,3H), 1.21-2.07(m,10H),0.87(t,J=6.7Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C30H34ClN4OS [M+]:533.2142,实测值:533.2149。

实施例6

3-氯-6-甲磺酰胺基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并 [b]噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-6-(methylsulfonamido)-N-((trans)-4-(propylamino) cyclohexyl)-N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

将实施例5制得的带有Boc保护基的Hh-0227(63mg,0.1mmol)和三乙胺 (20.8μl,0.15mmol)溶于10ml干燥的二氯甲烷,向其中加入MeSO2Cl(14mg, 0.12mmol),然后室温搅拌反应4小时后浓缩。将浓缩后的残留物溶于2ml的 二氯甲烷溶液,在0℃下加入0.5ml三氟乙酸,室温搅拌1小时,然后以2ml 饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷(3×10mL)萃取,合并有机相并用无水硫 酸钠干燥;真空浓缩后,残渣用硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=40/1) 得到48mg目标产物Hh-0215,两步总收率为78%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,DMSO)δ8.64(s,2H),7.29-7.80(m,9H), 4.79(s,2H),2.98(s,3H),2.35-2.50(m,3H),1.21-2.07(m,10H),0.87(t,J=6.7Hz, 3H);HRMS(ESI)理论值C31H36ClN4O3S2[M+]:611.1917,实测值:611.1922。

实施例7

3-氯-6-乙酰氨基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并[b] 噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-6-(actamido)-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl) -N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

将实施例5制得的带有Boc保护基的Hh-0227(63mg,0.1mmol)和三乙胺 (20.8μl,0.15mmol)溶于5ml干燥的二氯甲烷,向其中加入乙酰氯(10mg,0.12 mmol),然后室温搅拌反应3小时后浓缩。将浓缩后的残留物溶于2ml的二氯 甲烷溶液,在0℃下加入0.5ml三氟乙酸,室温搅拌1小时,然后以2ml饱 和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲烷(3×10mL)萃取,合并有机相并用无水硫酸 钠干燥;真空浓缩后,残渣用硅胶柱层析纯化(洗脱液用:二氯甲烷/甲醇=30/1) 得到42mg目标产物Hh-0218,两步总收率为74%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.65(s,2H),8.25(s,1H),7.28-7.65 (m,9H),4.78(br,2H),3.88-4.20(br,1H),2.70-2.88(m,3H),2.18(S,3H),1.92-2.10 (m,4H),1.26-2.14(m,10H),0.87(t,J=6.7Hz,3H);HRMS(ESI)理论值 C32H36ClN4O2S[M+]:575.2247,实测值:575.2246。

实施例8

3-氯-5,6-二羟基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并[b] 噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-5,6-dihydroxy-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl) -N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

将实施例3制得的化合物Hh-001(56mg,0.1mmol)溶于5ml干燥的二氯 甲烷,冷却至-78℃,并用氮气保护反应体系,用注射器慢慢滴加三溴化硼(22.6 μL,0.24mmol)。加完后,撤除低温浴,让反应体系自然升至室温并搅拌过夜。 反应结束后,加入30ml乙酸乙酯稀释反应液,并连续用饱和食盐水(3x4mL) 和水(2x4mL)洗涤。有机相用无水硫酸钠干燥,真空浓缩后,残渣用硅胶柱层 析纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=20/1)得到37mg目标产物Hh-002,收率为 68%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,DMSO)δ9.79(br,2H),8.79-8.95(m,3H), 7.18-8.26(m,7H),7.15-7.20(m,2H),4.80(s,2H),2.92-2.98(m,1H),2.65-2.75(m, 2H),2.02-2.15(m,2H),1.56-1.78(m,6H),1.20(m,2H),0.87(t,J=6.7Hz,3H); HRMS(ESI)理论值C30H33ClN3O3S[M+]:550.1931,实测值:550.1947。

实施例9

3-氯-6-羧基-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-(3-(4-吡啶基))苄基苯并[b]噻吩 -2-甲酰胺(3-chloro-6-carboxyl-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl) -N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

将实施例2制得的化合物Hh-006(28mg,0.05mmol)溶于2ml甲醇和2mL 0.25N KOH水溶液,混合物在40℃搅拌反应2小时。加入5ml的水,并搅拌 至均相。水相用乙醚萃取(2X4ml)以除去小极性的杂志。然后用浓盐酸酸化, 洗出固体,过滤出固体,水洗,干燥后得到18mg目标产物Hh-007,收率63%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,DMSO)δ8.58-8.66(m,3H),7.46-8.14(m, 8H),4.83(s,2H),4.29(m,1H),2.66-2.91(m,3H),1.53-2.07(m,6H),1.15-1.21(m, 4H),0.83(t,J=6.7Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C31H33ClN3O3S[M+]:562.1931, 实测值:562.1935。

实施例10

氮-(2,4’-联吡啶-6-基-甲基)-3-氯-氮-反式-4-丙胺基环己基苯并[b]噻吩-2- 甲酰胺(N-(2,4′-bipyridin-6-ylmethyl)-3-chloro-N-((trans)-4-(propylamino) cyclohexyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

结合图2,以2,4′-联吡啶-6-甲醛为原料,采用通用的制备步骤,即:1)还 原胺化;2)烷基化;3)酰胺化;4)脱Boc保护基;合成得到Hh-0273。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.75(d,J=5.7Hz,2H),7.39-7.94 (m,9H),4.76-4.93(br,2H),4.52(br,0.4H),3.82(br,0.6H),2.52-2.66(m,3H), 1.43-2.33(m,10H),0.88(t,J=7.2Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C29H32ClN4OS [M+]:519.19851,实测值:519.1986。

实施例11

3-氯-氮-反式-4-丙胺基环己基-氮-((2-(吡啶-4-基)-嘧啶)-4-基)甲基) 苯并[b]噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl) -N-((2-(pyridin-4-yl)pyrimidin-4-yl)methyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制 备

结合图2,以2-(吡啶-4-基)嘧啶-4-甲醛为原料,采用通用的制备步骤, 即:1)还原胺化;2)烷基化;3)酰胺化;4)脱Boc保护基;合成得到Hh-0530。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.78-8.83(m,3H),7.46-7.86(m, 7H),4.82(br,2H),4.52(m,0.4H),3.92(m,0.6H),2.73-2.90(m,3H),1.66-2.21(m, 10H),0.88(t,J=7.2Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C28H31ClN5OS[M+]: 520.1938,实测值:520.1943。

实施例12

3-氯-氮-(反式)-4-丙胺基环己基-氮-(3-(嘧啶-5-基)苄基)苯并[b]噻吩 -2-甲酰胺(3-chloro-N-((trans)-4-(propylamino)cyclohexyl)-N-(3-(pyrimidin-5-yl) benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

结合图5,以3-(嘧啶-5-基)苯甲醛为原料,采用通用的制备步骤,即:1) 还原胺化;2)烷基化;3)酰胺化;4)脱Boc保护基;合成得到Hh-0266。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ9.21(s,1H),8.79-8.98(br,2H), 7.49-7.84(m,8H),4.68-4.82(br,2H),3.80-4.28(m,1H),2.45-2.62(m3H), 1.25-2.06(m,10H),0.87(t,J=7.2Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C29H32ClN4OS [M+]:519.1985,实测值:519.1981。

实施例13

3-氯-氮-(3-吗啡啉苄基)-氮-((反式)-4-丙胺基环己基)苯并[b]噻吩-2- 甲酰胺(3-chloro-N-(3-morpholinobenzyl)-N-((1r,4r)-4-(propylamino)cyclohexyl) benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

结合图5,以3-(吗啡啉)苯甲醛为原料,采用通用的制备步骤,即:1) 还原胺化;2)烷基化;3)酰胺化;4)脱Boc保护基;合成得到Hh-0566。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ7.78-7.81(m,2H),7.43-7.52(m, 2H),7.00-7.22(m,1H)6.71-6.79(m,3H),4.55-4.68(m,2H),3.83-4.10(m,1H),3.83 (s,4H),3.21-3.25(m,4H),2.68-2.86(m,3H),2.57-2.60(br,4H),1.79-2.23(m,10H), 0.91(t,J=7.2Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C29H37ClN3O2S[M+]:526.2295,实测 值:526.2296。

实施例14

3-氯-氮-((反式)-4-(氮-丙基环丁烷甲酰胺基)环己基)-氮-(3-(4-吡啶 基))苄基苯并[b]噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-N-((trans)-4-(N- propylcyclobutanecarboxamido)cyclohexyl)-N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiop hene-2-carboxamide)的制备

将化合物Sant-75(52mg,0.1mmol)和三乙胺(20.8μl,0.15mmol)溶于5ml 干燥的二氯甲烷,向其中加入环丁烷甲酰氯(14mg,0.12mmol),然后室温搅拌 反应3小时后浓缩。将浓缩后的残留物用硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/ 甲醇=30/1)得到51mg目标产物Hh-01047,收率为86%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.67(br,2H),7.27-7.88(m,10H), 4.65-4.86(m,2H),3.82-3.98(m,1H),2.90-3.18(m,4H),1.28-2.32(m,16H),0.85(t, J=7.2Hz,3H);HRMS(ESI)理论值C35H39ClN3O2S[M+]:600.2452,实测值: 600.2437。

实施例15

3-氯-氮-((反式)-4-(氮-丙基尼古丁甲酰胺基)环己基)-氮-(3-(4-吡啶 基))苄基苯并[b]噻吩-2-甲酰胺(3-chloro-N-((trans)-4-(N-propylnicotinamido) cyclohexyl)-N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide)的制备

将化合物Sant-75(52mg,0.1mmol)和三乙胺(20.8μl,0.15mmol)溶于5ml 干燥的二氯甲烷,向其中加入尼古丁甲酰氯(17mg,0.12mmol),然后室温搅拌 反应3小时后浓缩。将浓缩后的残留物用硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/ 甲醇=20/1)得到45mg目标产物,收率为73%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.67(br,4H),7.19-7.91(m,12H), 4.71-4.88(m,2H),2.95-3.91(m,4H),1.44-2.01(m,10H),0.90(br,3H);HRMS(ESI) 理论值C36H36ClN4O2S[M+]:623.2247,实测值:623.2254。

实施例16

3-氯-氮-((反式)-4-(2-苯氧乙酰胺基)环己基)-氮-(3-(4-吡啶基))苄 基苯并[b]噻吩-2-甲酰胺3-chloro-N-((trans)-4-(2-phenoxyacetamido)cyclohexyl) -N-(3-(pyridin-4-yl)benzyl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide的制备

结合图6,化合物3c(190mg,0.5mmol)和三乙胺(104μL,0.75mmol)溶于 8ml的二氯甲烷溶液,加入3-氯代苯并噻吩酰氯(138mg,0.6mmol),室温搅 拌2小时后,移除溶剂,所得残留物溶于8ml的二氯甲烷溶液,在0℃下加入 2ml三氟乙酸,室温搅拌1小时,然后以8ml饱和碳酸钠淬灭反应,用二氯甲 烷(3×30mL)萃取,合并有机相并用无水硫酸钠干燥;真空浓缩后,所得中 间体溶于20ml干燥的二氯甲烷,向其中加入三乙胺(104μl,0.75mmol)和2-苯 氧乙酰氯(102mg,0.6mmol),然后室温搅拌反应3小时后浓缩。将浓缩后的残 留物用硅胶柱层析纯化(洗脱液:二氯甲烷/甲醇=20/1)得到198mg目标产物, 收率为65%。

产物经测定:1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.66(d,J=4.8Hz,2H),6.28-7.86 (m,15H),4.70-4.85(m,2H),4.40(s,2H),3.71-3.85(m 2H),1.65-1.95(m,8H); HRMS(ESI)理论值C35H33ClN3O3S[M+]:610.1931,实测值:610.1943。

性能测试一

分别选取具有代表性的化合物进行性能测定,具体化合物见表1。将上述化 合物作用于斑马鱼的FLK胚胎,通过显微镜观察胚胎发育型态的变化,可实现 在整个活体胚胎中在体内水平上检测Hh的活性:Hh通路被抑制的胚胎会有U 型体节(正常为V型),并且身体弯曲,眼睛发育异常。各化合物对FLK胚胎 表型的最低作用浓度实验结果如表1所示:

表1:代表化合物的转基因斑马鱼胚胎抑制试验

  化合物   最低作用浓度   Sant-75   5μM   Hh-0241   5μM   Hh-011   5μM   Hh-0273   50μM   Hh-0566   5μM   Hh-01047   1μM   Hh-01034   2.5μM   Hh-01121   20μM   Hh-01149   10μM   Hh-01137   20μM   Hh-01031   5μM   Hh-01157   0.6μM   Hh-01160   2.5μM   Hh-01186   20μM   Hh-01193   2.5μM

性能测试二

上述化合物采用Shh-Light2细胞系来进一步检测对Hh通路的活性,用只有 N端活性部分的合成的Shh蛋白作为信号分子,在培养基中加入上述待测的化 合物以及荧光素酶报告质粒。通过从1×10-2到1×104nM浓度梯度的检测, 发现化合物对Hh信号传导也有明显的抑制作用,结果见表2。对比文献(Taipale, J.,Chen,J.K.,Cooper,M.K.,Wang,B.,Mann.R.K.,Milenkovic,L.,Scott,M.P.,and Beachy,P.A.2000.Effects of oncogenic mutations in Smoothened and Patched can be reversed by cyclopamine.Nature 406:1005-1009.)中已经报道的Cyclopamine的 浓度要低(IC50=300nM)。

表2:代表化合物的Shh-light2细胞试验

  化合物 Normalized IC50 with Shh-light2   Sant-75 9nM   Hh-0241 2.5nM   Hh-011 17nM   Hh-0273 11nM   Hh-0566 136nM   Hh-01047 20.6nM   Hh-01034 15.2nM   Hh-01121 9.8nM   Hh-01149 11.4nM   Hh-01137 11.6nM   Hh-01031 23.8nM   Hh-01157 20.2nM   Hh-01160 6.9nM   Hh-01186 5.6nM   Hh-01193 13.1nM

由性能测试一和性能测试二可以看出,这种基于Sant-75结构的化合物,通 过对Sant-75进行系统的结构修饰,相对于Sant-75,其作为七次穿膜蛋白抑制 剂的生物学活性较高。

以上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式,其描述较为具体和详细, 但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域 的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形和 改进,这些都属于本发明的保护范围。因此,本发明专利的保护范围应以所附 权利要求为准。

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