使用临床知识来改善对下一代测序的使用

摘要

本文公开了一种确保在复杂的治疗决策中最佳地使用下一代测序(NGS)的方法(100)。这种方法可以包括：识别(105)符合条件进行下一代测序的受感染患者；确定(110)针对受感染患者的患者护理轨迹，其中，轨迹是根据对受感染患者与医疗资源的物理接触的数据库记录来确定的；对来自受感染患者的分离株进行测序(115)；在测序的同时，识别(120)有感染风险的额外患者，确定(125)受感染患者的患者护理轨迹与额外患者的患者护理轨迹的重叠，以及基于重叠以及针对额外患者的临床数据点来确定(130)对额外患者的感染风险；确定(135)对额外患者的更新的传播风险；以及使(140)计算设备绘制对一个或多个额外患者的更新的传播风险的输出。