Recni sistemi so najveckrat izpostavljeni antropogenim vplivom, ki vkljucujejo kemicno onesnazenost in evtrofikaci-jo. Vse to povzroca spremembe tudi v strukturi in pestrosti mikrobnih zdruzb v recnem sedimentu. Namen studije je bil z gojitvenimi in molekularnimi metodami prouciti pestrost in strukturo mikrobne zdruzbe sedimenta Kamniske Bistrice. Vzorce sedimenta smo odvzeli na treh mestih vzdolz toka reke: izvir (Kamniska Bistrica), srednji del (Vir) in spodnji del (Bisce) ter na terenu opravili osnovne fizikalno-kemijske analize. Ciste kulture smo iz sedimenta osamili in gojili na treh vrstah agarskih gojisc (LB, NB in R_2A) in jih mikro- in makro-morfolosko opisali. Iz cistih bakterijskih kultur in iz vzorcev sedimenta smo izolirali tudi genomsko DNAK. S sirokospeci-ricnimi bakterijskimi zacetnimi ologonukleotidi smo v reakciji PCR pomnozili ustrezne dele genov za 16S rRNA in jih analizirali z metodo gelske elektroforeze v gradientu denaturanta (DGGE). Ugotovili smo, da je metoda DGGE primernaza proucevanje pestrosti celokupne mikrobne zdruzbe recnega sedimenta in omogoca ugotavljanje vplivov dejavnikov okolja na raznolikost mikrobne zdruzbe. Profili analize DGGE mikrobnih zdruzb so se med mesti vzorcenja razlikovali, medtem ko profili cistihkultur po pricakovanju niso predstavljali stevilcno pomembnejsih bakterijskih populacij sedimenta. Na podlagi profilov DGGE smo izbrali 25 izolatov in za direktno sekvenciranje pripravili njihove pomnozke. Pridobljene sekvence dela gena za 16S rRNA smoz orodjem BLAST preliminarno taksonomsko uvrstili med skupine bakterij, ki so obicajno prisotne v vodnih okoljih.
展开▼
