CELULOSOMI IN CELULAZNI KONZORCIJ Ruminococcus flavefaciens 007C

摘要

Ruminococcus flavefaciens sodi med najpomembnejse celuloliticne bakterijske vrste v vampu prezvekovalcev in debelem crevesu monogastricnih rastlinojedih sesalcev. Njena izjemna ucinkovitost pri anaerobni razgradnji (hemi) celuloznih substratov je povezana s sintezo zunajcelicnih multiencimskih kompleksov celulosomov. V pricujocem delu smo preucili genomski potencial za sintezo celulosomov in celulaz seva 007C, izrazanje slednjih pa analizirali z encimogrami. V osnutku genoma tega seva smo identificirali v celoti ohranjeno gruco genov, ki kodirajo skafoldine, na osnovi njihove modularne zgradbe pa smo predvideli zgradbo celulosomov tega seva. Nabor genov za celulaze, ki smo jih identificirali v genomu seva 007C, obsega po en zapis za encima s katalitskima domenama GH48 in GH44 ter sirok spekter domnevnih endoglukanaz iz druzin GH9 in GH5. Pri vecini teh encimov smo identificirali doker-inske domene, kar kaze na to, da so vezani v celulosome. Module za vezavo na celulozo smo identificirali le v kombinaciji s katalitskimi domenami GH9. Ugotovili smo tudi, da se vecje endoglukanaze izrazajo konstitutivno, manjse encime pa smo zaznali le v supernatantu kultur, ki so daljsi cas rasle na mikrokristalinicni celulozi.