MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches

Mirdita Milot; Steinegger Martin; Soeding Johannes

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MMseqs2 desktop and local web server app for fast, interactive sequence searches

机译：MMSEQS2桌面和本地Web服务器应用程序，用于快速，交互式序列搜索

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A Summary: The MMseqs2 desktop and web server app facilitates interactive sequence searches through custom protein sequence and profile databases on personal workstations. By eliminating MMseqs2's runtime overhead, we reduced response times to a few seconds at sensitivities close to BLAST.

机译：摘要：MMSEQS2桌面和Web服务器应用程序有助于通过在个人工作站上的自定义蛋白质序列和配置文件数据库进行交互式序列搜索。通过消除MMSEQS2的运行时间开销，我们将响应时间减少到敏感性的敏感度靠近爆炸。

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来源
《Bioinformatics》 |2019年第16期|共3页
作者
Mirdita Milot; Steinegger Martin; Soeding Johannes;
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作者单位

Max Planck Inst Biophys Chem Quantitat &

Computat Biol D-37077 Gottingen Germany;

Max Planck Inst Biophys Chem Quantitat &

Computat Biol D-37077 Gottingen Germany;

Max Planck Inst Biophys Chem Quantitat &

Computat Biol D-37077 Gottingen Germany;

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原文格式 PDF
正文语种 eng
中图分类生物工程学（生物技术）;
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