複数植物種の遺伝子発現ネットワーク情報と高信頼度機能ァノテーシヨン情報を搭載し たWebデータベースPODC

摘要

膨大なォミックス情報を横断的に解析する ことにより，植物界の新規有用遺伝子'化合物 の探索と高度利用化が加速化される.たとえ ば,大規模トランスクリプト一ム情報から遺 伝子発現プロファイルの類似性を評価でき， 遺伝子の発現制御機構や生物学的機能の網羅 的な推定が可能となる.また，ゲノムや発現遺 伝子の塩基配列情報を活用し，植物種間の ォ一ソログ、パラログ情報を抽出することにより，遺伝子発現制御機構や生物学的機能に 着目した遺伝子フアミリー分類が可能とな る.そこで，当プロジヱクトでは，遺伝子発現 プロフアイルの類似性を網羅的、容易に把握 するために，複数植物種の遺伝子発現ネットワーク(Gene Expression Network; GEN) ^"構 築するとともに，植物種間ォ一ソ口グ情報の 整備を進めている.さらに，文献情報に基づい た高信頼度な遺伝子機能ァノテ一ションの付 与も進めている.また，これらの大規模ォミッ クス情報，および,高信頼度情報を利用し新規 有用遺伝子を効率的に探索するために，Web データベースplant Qmics Data Center (PODC)の開発.運営を進めている.本演題では， PODCの現バ一ジョンを紹介する.