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ONTO-ToolKit: enabling bio-ontology engineering via Galaxy

机译:ONTO-ToolKit:通过Galaxy启用生物本体工程

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摘要

BackgroundThe biosciences increasingly face the challenge of integrating a wide variety of available data, information and knowledge in order to gain an understanding of biological systems. Data integration is supported by a diverse series of tools, but the lack of a consistent terminology to label these data still presents significant hurdles. As a consequence, much of the available biological data remains disconnected or worse: becomes misconnected. The need to address this terminology problem has spawned the building of a large number of bio-ontologies. OBOF, RDF and OWL are among the most used ontology formats to capture terms and relationships in the Life Sciences, opening the potential to use the Semantic Web to support data integration and further exploitation of integrated resources via automated retrieval and reasoning procedures.
机译:背景技术为了获得对生物系统的了解,生物科学越来越面临整合各种可用数据,信息和知识的挑战。各种各样的工具都支持数据集成,但是缺乏一致的术语来标记这些数据仍然是一大障碍。结果,许多可用的生物学数据仍然不连贯甚至更糟:变得不连贯。解决这个术语问题的需要催生了许多生物本体论的建立。 OBOF,RDF和OWL是用于捕获生命科学中的术语和关系的最常用的本体格式,这打开了使用语义网来支持数据集成以及通过自动检索和推理程序进一步开发集成资源的潜力。

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