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Detecting overlapping protein complexes in PPI networks based on robustness

机译:基于鲁棒性的PPI网络中重叠蛋白复合物的检测

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摘要

BackgroundRecently, large data sets of protein-protein interactions (PPI) which can be modeled as PPI networks are generated through high-throughput methods. And locally dense regions in PPI networks are very likely to be protein complexes. Since protein complexes play a key role in many biological processes, detecting protein complexes in PPI networks is one of important tasks in post-genomic era. However, PPI networks are often incomplete and noisy, which builds barriers to mining protein complexes.
机译:背景技术近来,可以通过高通量方法生成可建模为PPI网络的大型蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据集。 PPI网络中的局部密集区域很可能是蛋白质复合物。由于蛋白质复合物在许多生物学过程中都起着关键作用,因此在PPI网络中检测蛋白质复合物是后基因组时代的重要任务之一。但是,PPI网络通常不完整且嘈杂,这为开采蛋白质复合物建立了障碍。

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