中国丙型肝炎患者中发现新的丙型肝炎病毒核苷酸序列

摘要

应用RT PCR和DNA克隆重组技术 ,从中国云南地区丙型肝炎患者血清中克隆到 3个丙型肝炎病毒 (HCV) 5′端非编码区 (5′NCR)核苷酸序列。这 3个序列分别来自 3个不同的丙型肝炎患者。与国内外已发表的HCV原型株同源序列比较研究发现 ,这 3个HCV 5′NCR序列中分别存在部分核苷酸序列的缺失或出现插入重复。在YS2 2 5 15′NCR序列 - 15 5～ - 174位之间 ,有 18个核苷酸序列缺失 ;在YS2 0 3 4和YS2 42 15′NCR序列 - 5 5～ - 5 6位之间 ,分别有 2 8个 (YS2 0 3 4)和 40个 (YS2 42 1)核苷酸序列插入。这些插入序列 (2 8个核苷酸 )在其相邻部位已有存在 ,即为重复序列。YS2 42 1插入序列中有 11个核苷酸出现两次重复。其它部位的核苷酸变异也同已知基因型的相应核苷酸变异有很大差异。结果表明 ,这