基于TCGA数据库的肺腺癌组织中CDT1表达及相关信号通路分析

摘要

目的 基于症基因组图谱(TCGA)数据库,观察染色质许可和DNA复制因子1(CDT1)在肺腺癌患者癌组织中的表达变化,分析癌组织中CDT1与患者临床病理特征、预后的相关性,并预测CDT1在肺腺癌中参与调节的信号通路.方法 从TCGA数据库中下载肺腺癌组织中CDT1基因表达谱及肺腺癌患者的临床病理信息,使用R3.6.1软件提取肺腺癌组织(肺腺癌组)及正常肺组织(正常对照组)CDT1的表达量数据,利用Mann-Whitney U检验比较两组间的表达差异.以CDT1表达水平的中位值(4.409)为界限将肺腺癌患者分为CDT1高表达组和CDT1低表达组,利用单因素及多因素COX回归分析癌组织中CDT1表达与患者临床病理特征的关系.利用R3.6.1软件"survival"包分析CDT1高、低表达组总体生存率(OS)的差异,并通过GEPIA、Kaplan Meier-plotter、UAL-CAN等在线工具对结果进行验证.利用基因集富集分析(GSEA)预测CDT1在肺腺癌中参与的分子通路.结果 肺腺癌组CDT1的表达水平高于正常对照组(P<0.001).肺腺癌组织中CDT1的表达水平与患者年龄(P=0.019)、Stage分期(P=0.007)及远处转移(P=0.042)等相关.Stage分期(HR=1.97,95％CI:1.22～3.17,P=0.005)和CDT1表达(HR=1.43,95％CI:1.14～1.79,P=0.002)可以作为肺腺癌的独立预后因素.CDT1高表达组生存率低于CDT1低表达组(P=0.029).CDT1主要参与细胞周期、嘌呤与嘧啶代谢、核苷酸切除修复以及p53信号通路等.结论 CDT1在肺腺癌患者中高表达,与肺腺癌患者的Stage分期及远处转移等相关,可作为导致肺腺癌不良预后的独立危险因子,并通过参与多种信号通路促进肺腺癌的发生发展.