一株H9亚型禽流感病毒HA基因的遗传变异分析

摘要

对2006年采集的1份禽流感病鸡组织进行RNA抽提后,采用A型流感病毒通用引物进行禽流感病毒HA基因的扩增,并进行T载体克隆及测序,获得了一株H9亚型禽流感病毒的HA序列.序列分析表明,此血凝素基因的ORF由1 683个核苷酸组成,编码560个氨基酸,属A/Chicken/Beijing/1/94系.将其在GenBank中Blast后发现,其与1株珍珠鸡H9N2病毒(A/Guineafowl/Hongkong/NT101/03)和1株鸡H9N2病毒(A/Chicken/Hongkong/AP45/03)的同源性和分值最高,同源性可达97%,较中国2006年前的分离株进化相对稳定,核苷酸的变异不大.切割位点的序列为-PARSSRGLF-,仍属于低致病力毒株.但Gln226Leu的变异,使其成为一种潜在的可感染人的禽源毒株.