芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析

摘要

利用拟南芥基因芯片,对白菜经芸薹链格孢菌侵染前后的基因表达谱进行比较分析.结果表明:差异表达基因385个,其中上调基因为280个,下调基因为105个.将所筛选出的差异表达基因分为14类,即:病程相关基因,防御相关基因,氧爆作用类,信号转导类,激素相关类,运输类,非生物胁迫类,细胞维持与发育,细胞壁修饰类,次生代谢类,代谢与合成类,蛋白降解类,及假想蛋白和未知功能蛋白.生物信息学分析显示,检测到的信号转导类基因差异表达比例最高,占24%;其次,防御基因和代谢合成基因占的比例也较高,分别达到13%和14%.值得注意的是,直接与病程发生相关差异表达的基因很少.同时,在差异表达基因中,未知蛋白和假想蛋白占有很大比例.