抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的中药化学成分虚拟筛选

摘要

cqvip:目的:从已有报道具有抗菌和抑菌作用的中药所包含化学成分中筛选出可能具有抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的前药。方法:从252篇文献中收集抗菌或者抑菌作用中药283味,包含化学成分6193个。使用化合物ADME的性质和Lipinski规则进行了初步筛选,得到了907个候选化合物。选择青霉素结合蛋白2a(PBP2a):蛋白3D结构(PDB ID:3ZG0,2.60 ),应用Discovery Studio 4.5(DS4.5)软件的CDOCKER模块进行分子对接,再以原配体打分值为参考开展系统筛选研究,筛选出具有新药开发前景的化合物。结果:在PBP2a蛋白的变构位点,对接良好的候选物共计66个;在活性位点,对接良好的候选物共计6个;在变构位点和活性位点对接均良好的候选物有2个。结论:本研究筛选出的70个化合物的来源中药均有抗菌或抑菌作用的报道,但是这些化合物至今为止还未进行过抗MRSA方面的研究,笔者希望这个结果能为新药研发提供参考。