冬虫夏草菌3个细胞核蛋白编码基因的分子进化

摘要

[目的]分析3个细胞核蛋白编码基因(csp1、MAT1-1-1和MAT1-2-1)在不同冬虫夏草菌株间的分子进化.[方法]从125个冬虫夏草样品中分别扩增csp1、MAT1-1-1和MAT1-2-1基因序列,比较外显子和内含子间以及2个交配型基因间的序列变异程度,比较基于不同基因或基因区域所构建的系统发育树拓扑结构的差异,分析3个基因承受的选择压力和DNA重组情况.[结果]3个蛋白编码基因外显子区的长度在不同菌株间高度保守,具有4.5％-5.7％的变异位点;内含子区的长度在不同菌株间相同或不同,具有1.8％-22％的变异位点.对于2个交配型基因,MAT1-1-1的碱基变异率低于MAT1-2-1.基于外显子与内含子构建的系统发育树的拓扑结构,以及基于2个交配型基因外显子构建的系统发育树的拓扑结构都存在明显差异.3个蛋白编码基因都经历着净化选择作用.基因内部的不同DNA位点间有重组,但3个基因片段之间没有明显的重组发生.[结论]由于冬虫夏草菌不同基因以及基因的不同区域表现出进化上的差异,所以在开展冬虫夏草菌进化相关的研究时,应该联合使用多个不同的基因片段.