基于高通量测序技术分析慢性牙周炎患者牙菌斑微生物多样性及群落结构

摘要

目的 采用16SrDNA高通量测序技术分析墨玉县口腔健康人群及慢性牙周炎人群的牙菌斑微生物群落结构特点及其差异性.方法 收集2018年8月在墨玉县体检的慢性牙周炎患者(20例)的牙菌斑样本为研究对象,以同时期体检口腔健康人群(15例)的牙菌斑样本为对照,通过Illumina MiSeq高通量测序技术(High-throughput sequencing)对牙菌斑中微生物16SrDNA基因组的V3-V4区进行测序,后续行微生物群落结构分析.结果 健康组的牙菌斑优势菌门为拟杆菌门(34.58％)、厚壁菌门(20.59％)、变形菌门(18.48％)、梭杆菌门(14.16％)、螺旋体门(2.16％)、糖化细菌门(2.36％)、放线菌门(5.74％),牙周炎组牙菌斑优势菌门为拟杆菌门(41.99％)、厚壁菌门(19.41％)、变形菌门(14.33％)、梭杆菌门(12.71％)、螺旋体门(4.34％)、糖化细菌门(2.90％)、放线菌门(2.74％),与健康组比较,拟杆菌门、螺旋体门在牙周炎组相对丰度增高,放线菌门相对丰度降低,差异有统计学意义(P<0.05),健康人群的牙菌斑优势菌属为普雷沃菌属(12.39％)、梭杆菌属(8.85％)、嗜二氧化碳噬纤维菌属(8.93％),卟啉单胞菌属(6.73％)、月形单胞菌属(3.46％)、密螺旋体属(2.24％)、伴放线放线杆菌属(4.14％)、韦荣菌属(2.82％)、弯曲菌属(2.39％)、纤毛菌属(5.31％)、分类未定糖细菌属(2.45％)、奈瑟菌属(7.06％)、链球菌属(6.14％)、棒状杆菌属(3.66％)、奥托氏菌(1.50％)、孪生球菌属(1.96％)、颗粒链菌属(1.11％)、罗氏菌属(1.07％),慢性牙周炎患者牙菌斑优势菌属为普雷沃菌属(22.21％)、梭杆菌属(9.97％)、卟啉单胞菌属(6.45％)、月形单胞菌属(5.93％)、嗜二氧化碳噬纤维菌属(5.71％)、密螺旋体属(4.57％)、伴放线放线杆菌属(4.56％)、韦荣菌属(3.84％)、弯曲菌属(3.43％)、纤毛菌属(3.26％)、分类未定糖细菌属(3.05％),奈瑟菌属(2.69％)、链球菌属(2.52％)、棒状杆菌属(1.80％)、奥托氏菌(1.13％),与健康组比较,牙周炎组普雷沃菌属、月形单胞菌属、密螺旋体属、卡氏菌属、小类杆菌属相对丰度增高,而奈瑟菌属、颗粒链菌属、嗜血杆菌属、心杆菌属相对丰度降低(P<0.05).结论 墨玉县牙周炎人群与口腔健康人群牙菌斑微生物群落结构具有一定差异.