基于转录组测序的白斑狗鱼性腺新转录本分析及基因结构优化

摘要

为了完善和优化白斑狗鱼(Esox lucius)基因组信息,解析白斑狗鱼性腺组织在转录水平上的差异表达,本研究对5个不同阶段的白斑狗鱼性腺组织进行转录组测序,构建cDNA文库,将重新组装的测序数据与白斑狗鱼参考基因组进行比对分析。结果显示,在本研究中挖掘了5240个白斑狗鱼性腺新转录本,同时不同程度的延伸了18715个基因的3'或5'端,在NR、NT、KO、SwissProt、Pfam、GO和COG/KOG等7个数据库分别成功注释了3179、4426、27、1412、2822、996和634个新转录本,其中GO富集分析显示,白斑狗鱼性腺差异新转录本在细胞过程和代谢过程等过程被显著富集。