基于转录组测序数据分析香猪基因组可变剪接事件

摘要

可变剪接(alternative splicing)是基因最常见的转录调控方式之一,是真核生物控制基因表达,使转录组和蛋白质组产生多样性的重要机制.本文采用Illumina Hiseq2000测序平台对高产和低产香猪共八个样本进行转录组测序,与Sus Scrofa10.2猪参考基因组进行比对.利用ASprofile从香猪基因组中共鉴定48755个可变剪接事件,影响19748个基因,占猪总基因数的78％.