乳腺癌他莫昔芬耐药相关基因及通路的筛选

摘要

目的:利用美国国家生物技术信息中心基因表达数据库中雌激素受体阳性乳腺癌表达谱芯片进行生物信息学分析,筛选他莫昔芬耐药的关键基因和信号通路.方法:利用基因芯片GSE26459,R软件分析得到差异基因,DAVID进行Gene Ontology和KEGG富集分析,STRING绘制蛋白作用网络.GSEA富集分析得到耐药相关通路及基因.结合蛋白作用网络筛选目标基因并验证.结果:筛选出差异基因1 516个,上调基因505个,下调基因624个.通路富集分析发现脂肪酸代谢通路、细胞粘附、胰岛素抵抗等信号通路在乳腺癌的他莫昔芬耐药中起重要作用,并在富集通路中筛选出ACSL1等候选目标基因并验证.结论:利用生物信息学有效分析他莫昔芬耐药的基因芯片数据,为他莫昔芬耐药的治疗靶点提供重要依据.