野猪、家猪及野家杂种猪CAPN1基因3'UTR区的SNPs检测及PCR-RFLP分析

摘要

μ-钙蛋白酶(μ-calpain,CAPN1)是动物体内肌原纤维蛋白降解的主要酶,为了揭示其基因变异与瘦肉率和嫩度的关系,文章以野猪、家猪及野家杂种猪为研究对象,通过测序和PCR-RFLP方法对CAPN1基因3'UTR进行了SNPs检测和多态性分析.结果表明,共发现7个SNPs,分别是C114T,G220C,C344T,T380C,G501A,T543C,T610E;对G220C/T380C两处突变建立了基于限制性内切酶HinfⅠ,AlwN Ⅰ的PCR-RFLP检测技术;群体遗传学分析表明,在这两个位点不同基因型在不同品种(品系)猪中的分布都存在着极显著的差异(P＜0.01),野猪和民猪之间的差异都不显著(P0.05),并且HinfⅠ位点的B等位基因频率具有随着品种瘦肉率的增加而增多的趋势.该结果为寻找高瘦肉率的分子标记提供了基础.