人参与三七鲨烯环氧酶家族的适应性进化

摘要

基于人参、三七基因组测序数据,在基因组水平上对SE基因家族进行鉴定,对其系统进化关系、基因结构、顺式作用元件以及SE基因复制事件等进行分析。结果表明,人参、三七的基因组中共鉴定到20个SE基因,聚为5个分支。SE基因在人参和三七中高度保守,所有SE均包含SE域和FAD/NAD(P)结合域。人参、三七的SE均含有干旱诱导元件、低温响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、脱落酸响应元件等参与对植物激素和非生物胁迫响应的关键顺式调控元件。适应性进化分析结果显示,人参和三七SE基因在自然选择中是以纯化选择为主,人参和三七SE基因在进化过程中高度保守。