格氏束腰蟹(Somanniathelphusa grayi)的线粒体基因组序列测定和基因顺序进化研究

摘要

格氏束腰蟹(Somanniathelphusa grayi(Alcock,1909))(=Parathelphusa(Parathelphusa)chongi Wu,1935)是一种分布于中国云南和印度Moung Sal的束腰蟹属淡水蟹物种.本文使用高通量测序技术首次获得了该物种的线粒体基因组近全长序列,测定的线粒体基因组为一个未闭合的环状DNA,长度为17654 bp,包括37个基因(22个tRNA基因,13个蛋白质编码基因和2个rRNA基因),AT含量为72.8%(35.1%A,18.4%C,8.8%G,37.7%T).除trnS1-AGN缺少一个稳固的双氢尿嘧啶(DHU)臂外,其余tRNA基因的二级结构均为典型的三叶草结构.与短尾下目线粒体基因组的祖先排列顺序比较发现,该种线粒体基因组共涉及6个tRNA基因(trnR,trnN,trnF,trnP,trnQ和trnC)和1个蛋白质编码基因(nad5)的顺序变化,与此前报道的两种束腰蟹的基因排列顺序一致.这些基因的重排可以用置换和复制/随机丢失(TDRL)模型进行解释.研究发现,这种重排的线粒体基因组顺序还见于两种在我国江西和海南岛异域分布的束腰蟹种类.提示这种线粒体基因组基因排序是束腰蟹属重要的共近裔特征.本研究可以为格氏束腰蟹的分类厘订,以及束腰蟹属近缘物种的系统分类和拟地蟹科类群的分子进化研究提供新的分子证据.