GlutPred:一种新型蛋白质戊二酰化位点的在线预测工具

摘要

蛋白质戊二酰化是一种新型的蛋白质翻译后修饰(PTM),它可以协调各种生物过程。计算预测方法可以提供快速、准确和有效的方法识别各种类型的PTM位点。然而,目前尚未见赖氨酸戊二酰化的在线预测工具报道。一个氨基酸可以由多个mRNA密码子编码,因此mRNA序列比蛋白质序列更为复杂,这种信息与戊二酰化的PTM的关系是什么?为了构建在线预测工具并回答此问题,本文收集了来自小鼠的蛋白组织的实验验证的蛋白质戊二酰化位点,在NCBI数据库中搜索这些位点的蛋白名对应的mRNA序列。通过蛋白质或mRNA序列信息,利用一个简单的矩阵构建了蛋白质戊二酰化位点的预测算法,并开发了蛋白质戊二酰化位点的在线预测工具GlutPred。