基于集成支持向量机的蛋白质K丙二酰化位点的预测

摘要

赖氨酸K丙二酰化是近些年来新发现的一种重要的蛋白质翻译后修饰(PTMs),对生物生长起着至关重要的作用。目前,通过蛋白质组的方法,部分丙二酰化修饰位点已经能够在实验中获取到,然而实验上耗费的时间和仪器上所花费的成本依然面临挑战。因此,开发一种能够准确预测丙二酰化位点的计算方法是有必要的。该系统的工作原理是:⑴将这些蛋白质组合成伪氨基酸(PseAAC);⑵使用下采样来平衡训练集数据集;⑶通过集成支持向量机建立一个综合的预测系统,最终,该系统独立测试集的准确率达到76.46%,效果比较明显,为生物信息学的研究提供帮助。