鼻咽癌细胞MeDIP-Seq测序reads在染色体上分布差异的研究

摘要

目的 探讨同源不同辐射抗拒鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)细胞DNA甲基化差异,期望从表观遗传学角度阐述人鼻咽癌辐射抗拒的发生机制. 方法 采用MeDIP-Seq测序法对CNE2R/CNE2细胞进行测序,分析比较DNA甲基化水平差异区间的分布. 结果 CNE-2R和CNE-2细胞甲基化分布差异主要集中在第5、6、7、9、13、17号染色体上,其中第5、6、13、17号染色体上为甲基化上调区间的密集区域,第7、9号染色体上为甲基化下调的密集区域. 结论 同源不同辐射抗拒鼻咽癌细胞CNE-2R和CNE-2细胞的甲基化水平存在差异;差异甲基化水平可能与辐射抗拒相关.