喉鳞状细胞癌相关microRNA的筛选及功能鉴定

摘要

目的 采用生物信息学技术及第二代RNA测序技术检测喉鳞状细胞癌相关microRNA,通过筛选及功能鉴定,为喉癌特定且有意义的靶向基因治疗提供依据.方法 临床收集3组经术后病理证实为喉鳞状细胞癌患者的喉癌与癌旁组样本,并应用第二代RNA测序技术检测喉癌及癌旁组织中miRNA的表达情况.采用生物信息学技术,对差异表达miRNA进行分层类聚分析及筛选;随机选取1种差异的表达的miRNA(miR-106a-5p),采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证miR-106a-5p在30例喉癌及癌旁组织中的表达水平.结果 3组喉癌及癌旁组织样本经第二代RNA测序,共检测到1624种miRNA;经过火山图及聚类分析共得到显著差异表达的miRNA 44种,其中表达上调21种,表达下降23种;经过qRT-PCR结果显示,miR-106a-5p在30例喉癌组织样本中表达水平(5.71±1.65),显著高于癌旁组织(2.66±0.87),差异具有统计学意义(P<0.05).结论 通过生物信息学方法筛选出喉癌差异表达miRNA,其中miR-106a-5p在喉癌组织的表达水平明显高于癌旁组织,与第二代测序结果一致.