基于RNA测序研究CUEDC1基因对急性单核细胞白血病THP-1细胞基因表达谱的影响

摘要

目的探讨CUEDC1基因对急性单核细胞白血病THP-1细胞基因表达谱的影响。方法构建CUEDC1基因干扰的THP-1细胞差异表达基因库。基于RNA测序技术比较CUEDC1基因干扰的THP-1细胞与阴性对照THP-1细胞基因表达谱的差异性表达。采用实时荧光定量聚合酶链反应验证差异表达的部分基因。将表达上调和下调的基因分别导入DAVID软件, 进行基因本体（GO）功能富集分析。结果成功构建CUEDC1基因干扰的THP-1细胞差异表达基因库。CUEDC1干扰组与阴性对照组间共检测到161个差异表达基因（P＆0.05）, 其中显著上调基因85个, 显著下调基因76个;与细胞增殖相关的基因9个, 与细胞凋亡相关的基因10个, 与p53基因有关的基因2个, 与转录调控有关的基因3个, 与泛素化有关的基因8个;其中SMAD5、SG15、CBLL1、FANCF等基因与急性白血病的发生发展密切相关。结论 CUEDC1基因可能影响SMAD5、SG15、CBLL1、FANCF等基因的表达, 进而参与了急性单核细胞白血病的发生发展。