九里香中香豆素类成分抗骨关节炎的分子对接研究

摘要

目的:研究九里香中香豆素类成分与骨桥蛋白的结合模式和相互作用.方法:采用AutoDock 4.2分子对接软件,将九里香中香豆素类成分共36个化合物和阳性对照单克隆抗体23C3的二维结构转化成三维结构,确立其空间坐标,再设置受体蛋白的网格,并运行对接程序,进行对接运算.结果:化合物13和化合物20对接的Ki分别为5.71 μmol·L-和4.11μmol· L-1,小于阳性对照23C3对接的Ki值19.95 μmol·L-1,对接数据最差的是化合物4,Ki值为154.48 μmol·L-1.对接构象上,23C3基本占据骨桥蛋白的疏水口袋和亲水口袋,化合物13和化合物20落人到骨桥蛋白的疏水口袋,与周围的Tyr49形成疏水相互作用力,表现出较强的结合能力;而化合物4既未占据骨桥蛋白疏水口袋,也未落入骨桥蛋白的亲水口袋,空间上与骨桥蛋白的活性位点不匹配,虚拟活性较弱.结论:九里香中香豆素成分有较强的抗炎活性,其中化合物13和化合物20虚拟活性最强,甚至强于阳性对照单克隆抗体23C3,化合物4在空间上与骨桥蛋白活性腔不匹配,虚拟活性最弱.化合物13和化合物20并未伸入骨桥蛋白的亲水活性口袋,是其结构修饰的方向,本研究将为骨桥蛋白抑制剂的开发提供一定理论指导.