山楂叶螨线粒体基因组的特征与系统发育与分析

摘要

山楂叶螨Amphitetranychus viennensis(Zacher,1920)又名山楂红蜘蛛,主要危害苹果、梨、桃、山楂和李等蔷薇科果树.山楂叶螨的分类归属在叶螨属Tetranychus与双叶螨属Amphitetranychus之间存在争议.因此,获得山楂叶螨的线粒体基因组可在解决其分类问题上提供更多依据.本研究通过长PCR扩增与高通量测序结合的方法得到完整山楂叶螨基因组,其大小为13 085 bp,共注释37个基因,包括13个蛋白编码基因、2个rRNA和22个tRNA.对tRNA的二级结构进行预测后发现有大量长度收缩的tRNA无法折叠成经典三叶草结构.遗传进化分析表明山楂叶螨与叶螨属的物种进化关系较近,但是山楂叶螨与叶螨属物种的遗传距离大于叶螨属内的遗传距离,因此通过对山楂叶螨线粒体基因组的分析支持山楂叶螨独立出叶螨属并归入双叶螨属.