蛋白质—小分子相互作用模型的构建

摘要

构建可解释和可大规模计算的蛋白质—小分子相互作用模型是一个重要的课题.提出一种新的蛋白质—小分子相互作用模型:首先分别用氨基酸三聚物集群和化合物结构片段来描述蛋白质和小分子;然后将蛋白质和小分子片段作为二部图的两部分,片段间的相互作用强度作为二部图的边;最后蛋白质和小分子的相互作用则是蛋白质片段和小分子片段之间相互作用的叠加.实验结果表明,该模型预测的准确率达到97％且具有很好的解释性.