应用高通量测序方法研究CRF01-AE亚型HIV-1毒株耐药突变的分子进化规律

摘要

目的 探讨CRF01-AE亚型人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株在药物选择压力下耐药突变发生和演变的规律.方法 选取5例一线方案治疗失败的CRF01-AE亚型HIV-1患者,收集其6～8年抗病毒治疗过程中的系列血样,应用高通量测序方法进行基因型耐药突变分析.结果 ①5例患者在启动治疗后早期即出现M184V突变以及非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)类耐药突变,常见的有K101E、G190A和K103N,其中M184V+ G190A+ TAMs是常见突变组合,停药或更换二线药物,这些突变也始终存在.②胸腺嘧啶脱氧核苷类似物变异(TAMs)突变形成过程中,有3例患者表现为TAM2路径,1例患者为TAM1途径,还有1例患者前期只有TAM2路径的突变,后期累加上TAM1途径的突变.③有3例患者在治疗过程中分别形成TAMs、Q151M复合体和T69插入复合物等多重耐药突变,更换二线方案后仍然治疗失败.结论 ①CRF01-AE亚型耐药患者在用药早期即开始出现耐药突变,数种突变逐渐累加,最终导致临床耐药,应尽早进行耐药突变监测.②TAMs突变通过2种途径竞争性发展,CRF01-AE亚型更偏向于TAM2途径,但随着治疗时间延长,2种途径可以产生融合.③更换二线方案前应排查针对替诺福韦(TDF)的耐药突变,其可能会导致二线方案无效.