钙结合蛋白S100A14的结构预测及分析

摘要

钙结合蛋白S100A14是S100家族中的新成员,其空间结构与功能尚未阐明.采用服务器PredietProtein 对人S100A14进行二级结构预测,利用同源建模法构建S100A14(序列12-102)的空间结构模型,经PROCHECK评估模型的可靠性,并将所构建的单体模型进行分子对接,预测S100A14形成同源二聚体的可能性及模式.结果显示,S100A14与S100A13的蛋白序列一致性最高,其C-端Ca2+ 结合区存在多个变异,但Cu2+和Zn2+结合位点保守存在;helix I与helix IV较S100A13延伸长,而helix Ⅰ、helix Ⅱ和helix Ⅳ与S100A13的四个α螺旋一样具有两亲性的结构特征,并且在S100A13中扮演重要角色的W77在S100A14的helix Ⅳ(W85)中也保守存在.空间结构上,S100A14与S100A13具极大相似性;分子对接显示S100A14单体间可以通过疏水作用力形成"X-型螺旋束"同源二聚体.这些结构特征的分析将为S100A14的功能研究提供重要线索.