中国龙虾微卫星标记的筛选及遗传多样性分析

摘要

文章以M13通用引物和重复序列(CT)15、(AT)15引物,利用PCR法对中国龙虾(Panulirus stimpsoni Hoehuis)部分基因组DNA文库进行筛选.共获得78个微卫星序列,分别分布于55个阳性重组克隆中,其中完美型(perfect)共50个,占64%;非完美型(imperfect)3个,占3.8%;混合完美型(compound perfect)6个,占7.7%;混合非完美型(compound imperfect),19个,占24.5%.根据微卫星序列,设计并筛选出15对微卫星多态性引物,对中国龙虾的群体进行了遗传多样性分析.获得3～12个等位基因,等位基因大小在78-425 bp之间,基本符合引物设计的理论长度.期望杂合度范围为0.48～0.87,平均值为0.71,表明中国龙虾基因组微卫星具有较高的杂合度与遗传多样性.15个微卫星位点的PIC值从0.44到0.84,平均值为0.60,说明这些微卫星位点在中国龙虾基因组中包含丰富的遗传信息,合适用于中国龙虾的各种分子标记及遗传学分析和应用.