鸭Fas基因SNP和生物信息学研究

摘要

试验以鸭为研究对象,构建DNA池,对Fas基因第2外显子、第3外显子和跨第6、第7外显子设计引物,PCR结合直接测序技术,筛选与扩增产物存在的SNP位点.结果表明:Fas基因第2外显子中检测到1个SNP位点(T729A),且引起天冬氨酸(GAT)转变为谷氨酸(GAA);mRNA二级结构最小自由能增加了133.76 kJ/mol,α螺旋和延伸链含量和所占蛋白质二级结构比例增加0.53％和0.27％,而自由卷曲数量减少了0.80％,且蛋白质三级结构发生明显变化,有可能影响Fas功能,从而对机体代谢产生影响.