地黄C3 H基因的克隆及生物信息学分析

摘要

香豆酸-3-羟化酶属于植物中最大的蛋白酶细胞色素P450家族之一,在植物生命活动中发挥着重要作用.为了解地黄香豆酸-3-羟化酶基因RgC3H合成毛蕊花糖苷的功能,该研究基于地黄代谢组学分析获得KEGG途径中的C3H,采用多重比对在NCBI中获得同源基因的一个保守序列,并基于该保守序列和地黄SRA数据库,采用电子克隆和RT-PCR克隆技术获得地黄C3H基因全长CDS(RgC3H),对其进行生物信息学分析.结果 表明:RgC3H基因全长为1530 bp,且编码一个含509个氨基酸、分子量为57.91 kD、无信号肽的蛋白质;基于氨基酸序列的结构分析显示,RgC3H有一个保守区域-P450结构域;系统进化分析结果显示,RgC3H与芝麻和猴面花的C3H基因具有很高的同源性.上述结果为进一步研究RgC3H基因在地黄毛蕊花糖苷生物合成途径中的作用奠定了基础.