9株猪圆环病毒Ⅱ型流行毒株全基因组克隆及序列分析

摘要

参考GenBank上发表的猪圆环病毒Ⅱ型（porcine circovirus2，PCV2）全基因组序列，设计一对引物，通过反向PCR技术扩增出9株PCV2流行株的全基因，并进行了序列测定与分析，结果表明：9株PCV2的基因组全长为1768bp或1767bp，同源性比较发现，本研究的9株PCV2之间的核苷酸同源性为95．6％～100％，与GenBank上已发表的PCV2分离株之间的同源性为95．1％～99．8％，与法国和新西兰代表株的亲缘关系较近，与美国、加拿大和澳大利亚代表株的亲缘关系较远。所得9株PCV2的ORF2核苷酸及其所推导的氨基酸序列同源性分别为93．1％～100％和91．8％～99．6％，存在较大的变异。