重庆柑橘产区柑橘褪绿矮缩病毒的发生、分布和分子特性研究

摘要

【目的】明确柑橘褪绿矮缩病(Citrus chlorotic dwarf-associated virus, CCDaV)在重庆柑橘产区的发生、分布和分子特性,为制定有效防治措施提供理论基础。【方法】对采自重庆的361份疑似感染褪绿矮缩病的柚类和柠檬样品进行CCDaV检测鉴定,通过背靠背引物扩增获得CCDaV的全序列,进而分别使用RDP4和SDTv.1.2进行重组和相似性分析,并采用邻接法构建系统发育树。【结果】在3份红宝石柚(Citrus paradisi)样品中检测出了CCDaV,其全长分别为3642、3640和3641 bp。全基因组分析未发现重组事件,且上述3个CCDaV毒株与已知41个CCDaV毒株的核苷酸和氨基酸相似性分别为99.1%~99.7%和97.3%~99.7%。系统进化树分析显示,本研究中CCDaV毒株被分为了4个不同的类群,其中巫溪样品WX-4-6和WX-4-9,与广东沙田柚上的CCDaV毒株聚在一簇;而巫溪样品WX-2-5与中国柚类上获得的CCDaV毒株聚于另一个分支。【结论】在重庆首次发现了CCDaV,可能是随带病苗木进入。