基于蛋白质相互作用网络探讨化痰散结方对三阴性乳腺癌Hedgehog信号通路相关蛋白Gli1的影响

摘要

目的:在构建三阴性乳腺癌(TNBC)的蛋白质相互作用网络基础上,探讨化痰散结方对TNBC MDAMB-231细胞增殖抑制作用以及对Hedgehog(Hh)通路转录因子Gli1表达的影响。方法:筛选在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获得TNBC相关基因;使用STRING进行文本挖掘并构建TNBC蛋白质相互作用网络;将互作数据读入Cytoscape3.4.0,分别应用插件JEPETTO 1.3.1和MCODE1.4.2实现拓扑分析和聚类分析;基于DAVID数据库富集关键通路用于表征簇的生物学重要性。针对关键通路Hh及其转录因子Gli1,采用MTT法检测化痰散结方对MDAMB-231细胞的增殖抑制率,Western blot法检测Gli1蛋白的表达情况。结果:构建了由1 537个节点(蛋白质)和23 681个边(相互作用)组成的蛋白质相互作用网络,分析得出关键通路H h信号传导通路和基因G l i1。实验结果表明化痰散结方能抑制MDA-MB-231细胞的增殖并能降低Gli1蛋白的表达。结论:TNBC蛋白质相互作用网络是一个受多信号通路传导、多基因调控的复杂过程,其中H h通路及其下游转录基因G l i1很可能是关键节点,而化痰散结方对MDA-MB-231细胞增殖的抑制作用机制之一是降低Hh通路中Gli1的表达。