基于ITS序列分析对海南普通野生稻籼粳分化的研究

摘要

对海南普通野生稻的18个居群分别进行ITS序列克隆和测序,研究海南普通野生稻居群的籼粳分化.结果表明,海南普通野生稻的ITS序列居群间差异性显著,ITS1长度为163 ～239 bp,G+C含量变化范围为53.5％～77.2％.ITS2长度为165～243bp,G+C含量变化范围为54.5％ ～74.2％.ITS1和ITS2区简约信息位点分别为108个和145个,单一信息位点分别为7个和2个.InDel(插入/缺失)位点分别为133个和145个,发现了9个ITS籼粳特异性位点.ClustalX软件排序及Mega构树结果表明,海南普通野生稻存在籼粳分化,偏籼型有10个居群,偏粳型有8个居群.本研究有助于揭示海南普通野生稻在起源演化上的地位,并为有效利用海南优良野生稻种质资源提供理论依据.